El Colegio se construye a través de cuatro grandes Áreas: Pedagógica, Pastoral, Institucional y de Apoyo. Cada una con estructuras delimitadas pero adecuadamente relacionadas entre sí y con el todo. El Área Pedagógica tiene a su cargo la dirección de los departamentos de Inicial, Primaria y Secundaria. El Área Pastoral es transversal a toda la institución y trabaja a través de los Equipos Pastorales. El Área Institucional está compuesta por los Departamentos de Desarrollo Organizacional y Recursos Humanos, el de Comunicación Institucional y la Oficina del Alumno. El Área de Apoyo es responsable de la administración, mantenimiento y limpieza del Colegio.

Periódicamente se reúnen los distintos equipos de trabajo (Directivo, Coordinador, Pedagógico) que permiten ver la globalidad de la institución.

La Dirección General del Colegio está integrada por el Dr. Elbio Medina y la Esc. Prof. Cecilia Gandini.